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棕櫚酰化調(diào)控 TNF 通路中的 RIPK1 激酶活性和細胞毒性

來源:上海達為科生物科技有限公司   2025年04月29日 14:25  

腫瘤壞死因子(TNF)是一種促炎細胞因子,對維持組織穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要。它通過與TNF受體1TNFR1)結(jié)合,

激活炎癥相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄,調(diào)控絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)和核因子κBNF-κB)通路,從而引發(fā)炎癥反應。

不過,TNF引發(fā)的細胞凋亡和壞死性凋亡也可能導致多種炎癥性疾病。受體相互作用絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶1RIPK1

TNF信號通路中的關(guān)鍵節(jié)點,它能協(xié)調(diào)細胞的生存與死亡。RIPK1的支架功能可誘導炎癥和細胞存活,

而其激酶功能則與凋亡和壞死性凋亡相關(guān)。

近日,中國科學院上海有機化學研究所生物與化學交叉研究中心許代超團隊與

華中科技大學同濟醫(yī)學院附屬協(xié)和醫(yī)院顧勁揚團隊合作,在 Cell 子刊Molecular Cell 上發(fā)表了題為:

Palmitoylationlicenses RIPK1 kinase activity and cytotoxicity in the TNF pathway”的研究論文。

該研究揭示了泛素化依賴性的棕櫚?;试SRIPK1激酶活性以誘導下游細胞死亡信號傳導,

并表明RIPK1棕櫚?;赡苁茄装Y性疾病的一個可行靶點。這一發(fā)現(xiàn)為理解RIPK1激酶激活提供了新的視角,

并提出了針對RIPK1棕櫚?;臐撛谥委煵呗浴?/span>



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文章要點

1TNF刺激下的RIPK1棕櫚?;?/span>

質(zhì)譜分析篩選出三個?;鞍祝?/span>RIPK1TNFR1TAB3。經(jīng)2-BP處理后,RIPK1TNFR1的棕櫚?;@著減少,

表明它們是2-BP敏感的棕櫚?;孜?。在HEK293T細胞中,2-BP處理使FLAG-RIPK1的棕櫚?;浇档?,確認了RIPK1的棕櫚酰化。

TNF-α刺激下,MEFsRIPK1的棕櫚酰化水平增加,呈現(xiàn)高分子量條帶,提示泛素化修飾存在。小鼠體內(nèi)實驗也顯示,

TNF-α刺激后肝臟組織中RIPK1的棕櫚?;皆黾印?strong style=";padding: 0px">研究表明,RIPK1TNF刺激下被棕櫚?;?,且這種棕櫚?;杀?/span>2-BP抑制。


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1 TNF刺激下的RIPK1棕櫚?;?/span>

2)棕櫚酰化促進RIPK1激酶活性

通過優(yōu)化的ABE實驗,使用NMM標記并經(jīng)質(zhì)譜鑒定,發(fā)現(xiàn)RIPK1Cys257C257)是主要棕櫚?;稽c。在TNF刺激下,

C257S突變體細胞系的RIPK1棕櫚?;@著降低,其他位點突變影響較小。CRISPR-Cas9技術(shù)生成的Ripk1C257S/C257S敲入小鼠

MEFs和肝臟組織中,TNF誘導的RIPK1棕櫚酰化也顯著降低。NanoBiT技術(shù)驗證表明,2-BP處理或C257S突變顯著減少RIPK1激酶

結(jié)構(gòu)域的同源相互作用。

這些結(jié)果確定了Cys257RIPK1的主要棕櫚?;稽c,并揭示棕櫚酰化促進RIPK1激酶活性和激酶結(jié)構(gòu)域的同源相互作用。


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2棕櫚?;龠MRIPK1激酶活性

3)棕櫚?;黾?/span>RIPK1細胞毒性

MEFs中抑制保護性檢查點并結(jié)合2-BPRIPK1-C257S突變,可顯著減少TNF誘導的RIPK1激酶依賴性凋亡。

2-BP處理或C257S突變降低RIPK1激酶活性及caspase-3切割,減少復合物IIb形成,表明RIPK1棕櫚?;瘜秃衔?/span>IIb組裝至關(guān)重要。

實驗顯示,2-BP處理或RIPK1-C257S突變能提高小鼠在TNF-α刺激下的存活率,

證明抑制RIPK1棕櫚?;杀Wo小鼠免受TNF誘導的致死效應,且RIPK1棕櫚酰化在促進細胞毒性中起重要作用。


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3 RIPK1棕櫚酰化增加細胞毒性

4DHHC5介導RIPK1棕櫚?;?/span>

通過短發(fā)夾RNA敲低23DHHC家族成員,篩選出6PAT,其中DHHC5被驗證為關(guān)鍵的RIPK1棕櫚酰化酶。

DHHC5敲低或缺失的MEFs中,TNF誘導的RIPK1棕櫚?;@著減少,表明其特異性參與且是必要條件。

體外實驗顯示,野生型DHHC5能有效催化RIPK1棕櫚?;?,而催化失活突變體DHHC5-C134SRIPK1-C257S突變體則不能。

鄰近連接實驗表明,TNF處理后MEFsRIPK1DHHC5有顯著相互作用,且在SM-164處理后消失,提示cIAP1/2介導的泛素化

促進DHHC5RIPK1結(jié)合。

免疫沉淀實驗表明,DHHC5TNF刺激下被募集到復合物I中,且主要依賴K63連接的泛素鏈。DHHC5是催化RIPK1棕櫚酰化的PAT。


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4 DHHC5介導RIPK1棕櫚酰化

5DHHC5促進RIPK1激酶活性和細胞毒性

DHHC5缺失的MEFs中,TNF刺激后復合物I中的p-S166 RIPK1水平顯著降低,表明DHHC5RIPK1激酶激活至關(guān)重要。

DHHC5缺失的細胞對T/5z7誘導的RDAT/C/Z誘導的壞死性凋亡敏感性降低,且RIPK1caspase的激活及復合物IIb的形成減少,

提示DHHC5通過促進RIPK1激酶活性調(diào)控復合物IIb組裝。同時,DHHC5缺失導致p-S166 RIPK1p-T231/S232 RIPK3、

p-S345 MLKL和壞死小體形成減少,表明其是RIPK1依賴性壞死性凋亡的關(guān)鍵調(diào)控因子。免疫共沉淀實驗顯示,

DHHC5缺失顯著降低RIPK1激酶結(jié)構(gòu)域之間的同源相互作用,支持DHHC5通過促進RIPK1棕櫚?;鰪娖浼っ富钚缘挠^點。

總之,DHHC5在促進RIPK1激酶活性和細胞毒性中起關(guān)鍵作用。

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5 DHHC5促進RIPK1激酶活性和細胞毒性

6)脂肪酸放大DHHC5促進RIPK1驅(qū)動的肝臟損傷

與正常飲食小鼠相比,膽堿缺乏高脂飲食(CD-HFD)小鼠RIPK1棕櫚?;斤@著增加,DHHC5蛋白水平顯著升高,

表明在MASH條件下RIPK1棕櫚?;鰪娗?/span>DHHC5特異性上調(diào)。棕櫚酸(PA)處理原代肝細胞可提高DHHC5 mRNA和蛋白水平,

PA處理肝細胞中c-JunDHHC5啟動子區(qū)域結(jié)合增強,表明脂肪酸通過JNK/c-Jun通路誘導DHHC5轉(zhuǎn)錄激活。

CD-HFD喂養(yǎng)的小鼠中,DHHC5缺失顯著降低RIPK1棕櫚?;?,減少RIPK1激酶活性、細胞死亡、炎癥因子表達及肝纖維化程度,

表明抑制DHHC5可緩解MASH引起的肝臟損傷。Nec-1s治療CD-HFD小鼠可降低ALTAST水平,

進一步證明RIPK1棕櫚?;?/span>MASH相關(guān)肝臟損傷中的重要性。

總之,在MASH模型中,DHHC5被脂肪酸放大,增加RIPK1棕櫚?;图毎拘?,導致肝臟損傷加重,而DHHC5缺乏或

RIPK1-C257S突變可有效減輕MASH相關(guān)肝臟損傷。


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6脂肪酸放大DHHC5促進RIPK1驅(qū)動的肝臟損傷

7RIPK1棕櫚?;毕轀p輕MASH相關(guān)肝臟損傷

RIPK1-C257S突變可抑制CD-HFD喂養(yǎng)小鼠的RIPK1激活與細胞死亡,降低血清ALT、AST水平,減少巨噬細胞浸潤,

降低促炎細胞因子及趨化因子表達,減輕肝臟纖維化,Nec-1s處理則削弱該保護作用。

這表明RIPK1-C257S突變通過抑制RIPK1的激活和細胞死亡,有效減輕MASH相關(guān)的肝臟損傷、炎癥反應和纖維化進程。


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7 RIPK1棕櫚?;毕轀p輕MASH相關(guān)肝臟損傷

文章小結(jié)

研究shou次揭示了泛素化依賴性的棕櫚?;试SRIPK1激酶活性以誘導下游細胞死亡信號傳導,并表明RIPK1棕櫚?;赡苁茄装Y性疾病的一個可行靶點。

這一發(fā)現(xiàn)為理解RIPK1激酶激活提供了新的視角,并提出了針對RIPK1棕櫚酰化的潛在治療策略。

參考文獻

Zhang N, Liu J, Guo R, et al. Palmitoylation licenses RIPK1 kinase activity and cytotoxicity in the TNF pathway[J]. Mol Cell, 2024,84(22):4419-4435.

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