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Nat Biotechnol:開發(fā)出通量高于當(dāng)前方法40倍的新技術(shù)

閱讀:961        發(fā)布時(shí)間:2018/4/11
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人類機(jī)體中有37萬億個(gè)細(xì)胞,然而將一種細(xì)胞與另外一種細(xì)胞進(jìn)行區(qū)分的能力或許并不像我們想象中那么簡單,近日,一項(xiàng)刊登在雜志Nature Biotechnology上的研究報(bào)告中,來自美國俄勒岡健康與科學(xué)大學(xué)(OHSU)的研究人員通過研究開發(fā)出了一種新方法,能夠快速且有效地識(shí)別體內(nèi)細(xì)胞的亞型,相關(guān)研究或能幫助研究人員在分子水平上理解多種人類疾病的發(fā)生機(jī)制。

圖片來源:medicalxpress

研究者表示,這種新技術(shù)或能幫助研究人員開發(fā)出治療多種疾病的療法,比如癌癥、破壞大腦神經(jīng)元的障礙,以及影響心臟和血管的疾病。同時(shí)這種技術(shù)還提供了一種新方法來擴(kuò)大此前研究人員分析細(xì)胞類型的方法,這種方法是通過對DNA進(jìn)行化學(xué)標(biāo)記來對細(xì)胞進(jìn)行有效區(qū)分的。

研究者Adey教授指出,這種技術(shù)在任何有細(xì)胞類型異質(zhì)多樣性的環(huán)境中都是非常有價(jià)值的,我們的主要研究領(lǐng)域是癌癥和神經(jīng)科學(xué),但我們也希望將該技術(shù)應(yīng)用于心血管疾病的研究中;所有細(xì)胞都攜帶著相同的基因組,即具有編碼功能的完整基因集合,在既定細(xì)胞中基因表達(dá)的模式能夠幫助研究者有效區(qū)分神經(jīng)元細(xì)胞和肝臟細(xì)胞。

即使那樣,事實(shí)證明相似的細(xì)胞之間也會(huì)有區(qū)別,2017年研究人員就通過測定不同細(xì)胞間的化學(xué)標(biāo)志物,即DNA的甲基化模式,來有效區(qū)分神經(jīng)元的類型。這項(xiàng)研究中,研究人員就開發(fā)了一種新方法,其能通過向每個(gè)細(xì)胞中添加*的DNA序列組合或索引來對單一細(xì)胞大量的甲基化組進(jìn)行特性分析;研究人員利用這種新型索引技術(shù)對多個(gè)人類細(xì)胞系和小鼠大腦細(xì)胞進(jìn)行研究后揭示出了3282個(gè)單一細(xì)胞的甲基化組(methylome),在通量方面,其要比當(dāng)前單細(xì)胞測序的方法高出將近40倍。

zui后研究者Adey說道,我們能夠?qū)Τ汕先f個(gè)細(xì)胞同時(shí)進(jìn)行分析,這項(xiàng)新技術(shù)還能夠降低我們制備單細(xì)胞DNA甲基化文庫的成本,其能講成本從每個(gè)細(xì)胞20-50美元降低到50美分。(生物谷)

原始出處:

Ryan M Mulqueen, Dmitry Pokholok, Steven J Norberg, et al. Highly scalable generation of DNA methylation profiles in single cells. Nature Biotechnology, 09 April 2018. doi:10.1038/nbt.4112

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