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技術(shù)文章
院士研究組文章公布蛋白質(zhì)組新技術(shù)
閱讀：745 發(fā)布時間：2011-9-2| 摘要： 來自中科院大連化學(xué)物理研究所，第二軍醫(yī)大學(xué)等處的研究人員發(fā)展了基于糖蛋白固載的無標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，并應(yīng)用于肝癌臨床診斷標志物的初步篩選中，發(fā)現(xiàn)了一系列在肝癌血清中異常表達的糖基化蛋白。這一研究成果公布在蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域刊物Molecular & Cellular Proteomics上。 |
生物通報道：來自中科院大連化學(xué)物理研究所，第二軍醫(yī)大學(xué)等處的研究人員發(fā)展了基于糖蛋白固載的無標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，并應(yīng)用于肝癌臨床診斷標志物的初步篩選中，發(fā)現(xiàn)了一系列在肝癌血清中異常表達的糖基化蛋白。這一研究成果公布在蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域刊物Molecular & Cellular Proteomics上。 如何加速細胞培養(yǎng)與分析和蛋白純化流程，請關(guān)注Millipore新產(chǎn)品，索要相關(guān)技術(shù)資料>> >> 這項研究由第二軍醫(yī)大學(xué)王紅陽院士研究組，與中科院大連化學(xué)物理研究所鄒漢法研究組合作完成，其中王紅陽院士早年畢業(yè)于第二軍醫(yī)大學(xué)，是教育部“長江學(xué)者獎勵計劃”特聘教授，中國工程院院士。長期從事腫瘤的基礎(chǔ)與臨床研究，對腫瘤的跨膜信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、肝癌新分子標志物鑒定及應(yīng)用、酪氨酸磷酸酶的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控研究等有重要建樹。 蛋白質(zhì)糖基化是目前已知的zui為復(fù)雜的翻譯后修飾之一，與癌癥的發(fā)生密切相關(guān)，目前已知的診斷標志物都是糖基化蛋白質(zhì)。然而，由于糖基化位點存在微觀不均一性，傳統(tǒng)的基于糖肽的定量方法不能準確的反映生物樣品中糖基化蛋白的表達水平。 在這篇文章中，研究人員發(fā)展了新型的基于非糖肽的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，較好地解決了高通量糖基化蛋白定量中的準確性和可靠性問題，并將這一方法運用于肝癌臨床診斷差異表達定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析中，發(fā)現(xiàn)了一系列在肝癌血清中異常表達的糖基化蛋白，采用傳統(tǒng)的基于抗體的ELISA方法對其中的3個糖蛋白質(zhì)進行大樣本量（50-100個臨床樣品）的驗證，進一步證明了所發(fā)展的方法對糖蛋白質(zhì)組學(xué)定量分析的可靠性。這一方法的發(fā)展不僅為疾病蛋白質(zhì)組學(xué)的研究提供了新的技術(shù)途徑，而且也篩選出一系列可供臨床驗證的差異糖基化蛋白質(zhì)。 除此之外，近期來自斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院等處的研究人員還利用一種高精度蛋白質(zhì)組學(xué)，識別出了與Jourbert綜合癥（Joubert syndrome, JS）等疾病相關(guān)的基因。這一發(fā)現(xiàn)增加了人們對JS這種病的進一步認識和了解。這種基因的發(fā)現(xiàn)讓研究人員進一步了解大腦、視網(wǎng)膜和腎臟的發(fā)育，更好地了解正常和異常的大腦并zui終找到治療相關(guān)疾病的有效方法。 注： 無標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù) 目前，蛋白質(zhì)組研究的實驗技術(shù)流程一般為樣品（蛋白混合物） 經(jīng)二維凝膠電泳，染色，膠上蛋白酶切，進入質(zhì)譜鑒定；或樣品（蛋白混合物） 直接經(jīng)酶切，色譜分離，進入質(zhì)譜進行鑒定。在二維凝膠電泳的實驗中，可以通過比較染色后的2 張2DE-gel 圖像中蛋白點的光密度值進行差異定量，或比較同種蛋白經(jīng)同位素標記和未經(jīng)標記的串聯(lián)質(zhì)譜峰面積進行差異定量。 但這2 種常用技術(shù)由于在樣品處理上費時費力，不利于大規(guī)模的蛋白質(zhì)組定量。因此，興起了無標記的質(zhì)譜定量方法，這種方法只需分析大規(guī)模鑒定蛋白時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)， 用蛋白相應(yīng)肽段的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行定量。非標記定量技術(shù)在定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究中受到了眾多科學(xué)工作者的推崇。目前，已經(jīng)有一系列配套的非標記定量分析軟件，其中包括的GE公司開發(fā)的DeCyder MSTM商業(yè)化軟件，實踐證明其具有很好的定量準確性和可信性。 （生物通：萬紋） |